Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC6LQ2NKX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERCC6LQ2NKX8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERCC6LQ2NKX8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms