Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC27Q2M243 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC27Q2M243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC27Q2M243 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms