Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKFB3Q16875 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKFB3Q16875 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PFKFB3Q16875 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PFKFB3Q16875 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
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