Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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PTPROQ16827 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPROQ16827 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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