Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIP10Q15642 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIP10Q15642 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP10Q15642 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms