Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD6Q15008 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD6Q15008 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
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