Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAF1Q13077 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAF1Q13077 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF1Q13077 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF1Q13077 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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