Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX4Q12846 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX4Q12846 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX4Q12846 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX4Q12846 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX4Q12846 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STX4Q12846 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX4Q12846 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX4Q12846 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX4Q12846 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX4Q12846 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX4Q12846 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX4Q12846 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STX4Q12846 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX4Q12846 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX4Q12846 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX4Q12846 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX4Q12846 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
STX4Q12846 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX4Q12846 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX4Q12846 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX4Q12846 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX4Q12846 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX4Q12846 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX4Q12846 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX4Q12846 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX4Q12846 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX4Q12846 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX4Q12846 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX4Q12846 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX4Q12846 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX4Q12846 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX4Q12846 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX4Q12846 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX4Q12846 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX4Q12846 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX4Q12846 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX4Q12846 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX4Q12846 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX4Q12846 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX4Q12846 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX4Q12846 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX4Q12846 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX4Q12846 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX4Q12846 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX4Q12846 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX4Q12846 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX4Q12846 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX4Q12846 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX4Q12846 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX4Q12846 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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