Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREMQ03060 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREMQ03060 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREMQ03060 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREMQ03060 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREMQ03060 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREMQ03060 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CREMQ03060 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREMQ03060 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREMQ03060 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREMQ03060 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREMQ03060 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREMQ03060 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREMQ03060 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREMQ03060 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREMQ03060 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREMQ03060 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREMQ03060 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CREMQ03060 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREMQ03060 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREMQ03060 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREMQ03060 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREMQ03060 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREMQ03060 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREMQ03060 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREMQ03060 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREMQ03060 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREMQ03060 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREMQ03060 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREMQ03060 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREMQ03060 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREMQ03060 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREMQ03060 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREMQ03060 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREMQ03060 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREMQ03060 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREMQ03060 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREMQ03060 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREMQ03060 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREMQ03060 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREMQ03060 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREMQ03060 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREMQ03060 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CREMQ03060 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREMQ03060 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREMQ03060 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREMQ03060 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREMQ03060 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREMQ03060 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CREMQ03060 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREMQ03060 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREMQ03060 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREMQ03060 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREMQ03060 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREMQ03060 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CREMQ03060 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREMQ03060 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREMQ03060 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CREMQ03060 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CREMQ03060 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREMQ03060 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREMQ03060 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREMQ03060 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREMQ03060 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms