Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXK2Q01167 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXK2Q01167 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXK2Q01167 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms