Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN10P78369 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN10P78369 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLDN10P78369 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN10P78369 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms