Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN2P57739 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN2P57739 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN2P57739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN2P57739 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms