Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLDN2P57739 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLDN2P57739 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLDN2P57739 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLDN2P57739 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLDN2P57739 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLDN2P57739 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CLDN2P57739 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLDN2P57739 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLDN2P57739 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLDN2P57739 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLDN2P57739 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLDN2P57739 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLDN2P57739 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLDN2P57739 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLDN2P57739 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLDN2P57739 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLDN2P57739 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLDN2P57739 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLDN2P57739 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLDN2P57739 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLDN2P57739 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLDN2P57739 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLDN2P57739 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLDN2P57739 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLDN2P57739 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLDN2P57739 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLDN2P57739 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLDN2P57739 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CLDN2P57739 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLDN2P57739 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLDN2P57739 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLDN2P57739 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLDN2P57739 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLDN2P57739 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLDN2P57739 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLDN2P57739 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLDN2P57739 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLDN2P57739 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLDN2P57739 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLDN2P57739 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CLDN2P57739 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLDN2P57739 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLDN2P57739 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CLDN2P57739 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLDN2P57739 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CLDN2P57739 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN2P57739 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLDN2P57739 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLDN2P57739 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN2P57739 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN2P57739 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN2P57739 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN2P57739 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLDN2P57739 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLDN2P57739 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN2P57739 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLDN2P57739 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLDN2P57739 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLDN2P57739 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLDN2P57739 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLDN2P57739 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN2P57739 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN2P57739 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLDN2P57739 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLDN2P57739 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLDN2P57739 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLDN2P57739 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLDN2P57739 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLDN2P57739 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLDN2P57739 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLDN2P57739 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLDN2P57739 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN2P57739 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLDN2P57739 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN2P57739 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN2P57739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLDN2P57739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN2P57739 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLDN2P57739 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN2P57739 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLDN2P57739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLDN2P57739 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLDN2P57739 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms