Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUBP1P53384 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUBP1P53384 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUBP1P53384 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms