Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR5P51681 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR5P51681 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR5P51681 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR5P51681 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR5P51681 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR5P51681 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR5P51681 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR5P51681 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR5P51681 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR5P51681 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR5P51681 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR5P51681 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR5P51681 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR5P51681 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR5P51681 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR5P51681 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR5P51681 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR5P51681 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR5P51681 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR5P51681 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR5P51681 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR5P51681 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR5P51681 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR5P51681 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR5P51681 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR5P51681 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR5P51681 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR5P51681 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR5P51681 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR5P51681 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR5P51681 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR5P51681 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR5P51681 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR5P51681 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR5P51681 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCR5P51681 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCR5P51681 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR5P51681 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR5P51681 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR5P51681 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR5P51681 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCR5P51681 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCR5P51681 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR5P51681 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCR5P51681 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCR5P51681 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCR5P51681 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCR5P51681 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR5P51681 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCR5P51681 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR5P51681 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR5P51681 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR5P51681 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR5P51681 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR5P51681 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR5P51681 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR5P51681 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms