Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFSF10P50591 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF10P50591 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF10P50591 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms