Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPB2P35606 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPB2P35606 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPB2P35606 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPB2P35606 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COPB2P35606 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPB2P35606 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPB2P35606 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPB2P35606 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPB2P35606 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPB2P35606 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
COPB2P35606 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COPB2P35606 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COPB2P35606 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COPB2P35606 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COPB2P35606 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPB2P35606 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPB2P35606 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPB2P35606 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPB2P35606 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPB2P35606 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPB2P35606 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPB2P35606 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COPB2P35606 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPB2P35606 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COPB2P35606 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPB2P35606 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPB2P35606 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPB2P35606 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COPB2P35606 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COPB2P35606 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COPB2P35606 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COPB2P35606 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COPB2P35606 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPB2P35606 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COPB2P35606 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPB2P35606 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPB2P35606 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPB2P35606 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COPB2P35606 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COPB2P35606 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COPB2P35606 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COPB2P35606 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COPB2P35606 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPB2P35606 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COPB2P35606 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COPB2P35606 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COPB2P35606 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COPB2P35606 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COPB2P35606 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COPB2P35606 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COPB2P35606 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COPB2P35606 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COPB2P35606 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COPB2P35606 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COPB2P35606 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COPB2P35606 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COPB2P35606 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COPB2P35606 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPB2P35606 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPB2P35606 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPB2P35606 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPB2P35606 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPB2P35606 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPB2P35606 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COPB2P35606 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms