Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC8P31273 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC8P31273 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms