Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HOXC8P31273 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HOXC8P31273 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HOXC8P31273 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
HOXC8P31273 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HOXC8P31273 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HOXC8P31273 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HOXC8P31273 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
HOXC8P31273 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HOXC8P31273 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HOXC8P31273 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HOXC8P31273 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HOXC8P31273 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HOXC8P31273 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HOXC8P31273 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HOXC8P31273 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HOXC8P31273 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HOXC8P31273 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HOXC8P31273 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HOXC8P31273 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HOXC8P31273 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HOXC8P31273 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXC8P31273 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXC8P31273 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HOXC8P31273 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HOXC8P31273 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HOXC8P31273 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXC8P31273 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXC8P31273 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HOXC8P31273 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HOXC8P31273 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HOXC8P31273 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXC8P31273 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HOXC8P31273 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HOXC8P31273 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXC8P31273 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
HOXC8P31273 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HOXC8P31273 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXC8P31273 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXC8P31273 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXC8P31273 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXC8P31273 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXC8P31273 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HOXC8P31273 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HOXC8P31273 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HOXC8P31273 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HOXC8P31273 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HOXC8P31273 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HOXC8P31273 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HOXC8P31273 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HOXC8P31273 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HOXC8P31273 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HOXC8P31273 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
HOXC8P31273 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HOXC8P31273 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HOXC8P31273 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HOXC8P31273 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXC8P31273 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HOXC8P31273 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HOXC8P31273 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HOXC8P31273 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HOXC8P31273 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HOXC8P31273 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXC8P31273 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXC8P31273 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXC8P31273 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXC8P31273 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXC8P31273 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXC8P31273 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXC8P31273 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXC8P31273 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXC8P31273 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXC8P31273 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXC8P31273 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXC8P31273 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXC8P31273 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXC8P31273 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXC8P31273 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HOXC8P31273 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXC8P31273 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXC8P31273 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXC8P31273 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXC8P31273 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
HOXC8P31273 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HOXC8P31273 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms