Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
DNMT1P26358 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
DNMT1P26358 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DNMT1P26358 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DNMT1P26358 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms