Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIP17213 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIP17213 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIP17213 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIP17213 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIP17213 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIP17213 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIP17213 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIP17213 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIP17213 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIP17213 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIP17213 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIP17213 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIP17213 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIP17213 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIP17213 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIP17213 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIP17213 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIP17213 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BPIP17213 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIP17213 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIP17213 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIP17213 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIP17213 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIP17213 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIP17213 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIP17213 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIP17213 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIP17213 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIP17213 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BPIP17213 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BPIP17213 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIP17213 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIP17213 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIP17213 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIP17213 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIP17213 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIP17213 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIP17213 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIP17213 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIP17213 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIP17213 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms