Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM18P0DKX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM18P0DKX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms