Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LCTP09848 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCTP09848 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCTP09848 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LCTP09848 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LCTP09848 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCTP09848 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCTP09848 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCTP09848 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCTP09848 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCTP09848 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCTP09848 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LCTP09848 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LCTP09848 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCTP09848 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCTP09848 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCTP09848 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCTP09848 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCTP09848 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCTP09848 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCTP09848 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LCTP09848 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCTP09848 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCTP09848 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCTP09848 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCTP09848 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCTP09848 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LCTP09848 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCTP09848 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCTP09848 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCTP09848 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCTP09848 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LCTP09848 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCTP09848 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCTP09848 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCTP09848 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCTP09848 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCTP09848 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCTP09848 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCTP09848 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCTP09848 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LCTP09848 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCTP09848 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCTP09848 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCTP09848 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCTP09848 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCTP09848 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCTP09848 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCTP09848 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCTP09848 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCTP09848 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCTP09848 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCTP09848 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCTP09848 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCTP09848 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCTP09848 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCTP09848 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCTP09848 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCTP09848 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCTP09848 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCTP09848 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCTP09848 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCTP09848 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LCTP09848 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCTP09848 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCTP09848 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCTP09848 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCTP09848 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCTP09848 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms