Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGAP02671 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGAP02671 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGAP02671 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGAP02671 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGAP02671 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGAP02671 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FGAP02671 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGAP02671 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FGAP02671 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGAP02671 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FGAP02671 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGAP02671 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGAP02671 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGAP02671 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGAP02671 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGAP02671 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGAP02671 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGAP02671 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGAP02671 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGAP02671 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGAP02671 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGAP02671 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGAP02671 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGAP02671 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGAP02671 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGAP02671 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGAP02671 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGAP02671 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGAP02671 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGAP02671 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGAP02671 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGAP02671 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGAP02671 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGAP02671 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGAP02671 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGAP02671 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGAP02671 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGAP02671 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGAP02671 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGAP02671 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGAP02671 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGAP02671 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGAP02671 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGAP02671 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGAP02671 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGAP02671 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGAP02671 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGAP02671 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGAP02671 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGAP02671 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGAP02671 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGAP02671 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGAP02671 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGAP02671 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGAP02671 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGAP02671 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGAP02671 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGAP02671 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGAP02671 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGAP02671 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGAP02671 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGAP02671 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGAP02671 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGAP02671 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGAP02671 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGAP02671 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FGAP02671 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms