Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL2A1P02458 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL2A1P02458 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL2A1P02458 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms