Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGPS1O95749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GGPS1O95749 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GGPS1O95749 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GGPS1O95749 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GGPS1O95749 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GGPS1O95749 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGPS1O95749 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GGPS1O95749 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGPS1O95749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGPS1O95749 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGPS1O95749 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GGPS1O95749 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGPS1O95749 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGPS1O95749 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GGPS1O95749 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGPS1O95749 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGPS1O95749 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGPS1O95749 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms