Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA2O43364 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXA2O43364 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXA2O43364 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms