Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH2O43255 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH2O43255 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH2O43255 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH2O43255 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIAH2O43255 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH2O43255 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH2O43255 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIAH2O43255 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH2O43255 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIAH2O43255 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIAH2O43255 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms