Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN9O14815 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN9O14815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN9O14815 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN9O14815 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms