Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSO14618 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSO14618 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSO14618 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSO14618 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSO14618 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSO14618 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSO14618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSO14618 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSO14618 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSO14618 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSO14618 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSO14618 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCSO14618 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCSO14618 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCSO14618 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCSO14618 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCSO14618 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCSO14618 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCSO14618 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSO14618 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSO14618 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSO14618 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSO14618 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCSO14618 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms