Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
E9PCH4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
E9PCH4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
E9PCH4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
E9PCH4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
E9PCH4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
E9PCH4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
E9PCH4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
E9PCH4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
E9PCH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
E9PCH4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
E9PCH4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
E9PCH4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
E9PCH4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
E9PCH4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
E9PCH4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
E9PCH4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
E9PCH4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
E9PCH4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
E9PCH4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
E9PCH4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
E9PCH4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
E9PCH4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
E9PCH4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
E9PCH4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
E9PCH4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
E9PCH4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
E9PCH4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
E9PCH4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
E9PCH4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
E9PCH4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
E9PCH4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
E9PCH4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
E9PCH4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
E9PCH4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
E9PCH4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
E9PCH4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
E9PCH4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
E9PCH4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
E9PCH4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
E9PCH4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
E9PCH4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
E9PCH4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
E9PCH4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
E9PCH4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
E9PCH4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
E9PCH4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
E9PCH4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
E9PCH4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
E9PCH4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
E9PCH4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
E9PCH4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
E9PCH4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
E9PCH4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
E9PCH4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
E9PCH4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
E9PCH4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
E9PCH4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
E9PCH4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
E9PCH4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
E9PCH4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms