Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVV-1B6SEH8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
ERVV-1B6SEH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ERVV-1B6SEH8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVV-1B6SEH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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