Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD3A6NKT7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD3A6NKT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
RGPD3A6NKT7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RGPD3A6NKT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms