Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POM121BA6NF01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POM121BA6NF01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POM121BA6NF01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POM121BA6NF01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POM121BA6NF01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POM121BA6NF01 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms