Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms