Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMA1P25786 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms