Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSMA1P25786 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSMA1P25786 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMA1P25786 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA1P25786 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMA1P25786 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMA1P25786 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMA1P25786 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSMA1P25786 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMA1P25786 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMA1P25786 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA1P25786 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMA1P25786 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMA1P25786 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA1P25786 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA1P25786 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA1P25786 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMA1P25786 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA1P25786 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMA1P25786 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMA1P25786 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMA1P25786 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMA1P25786 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMA1P25786 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA1P25786 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA1P25786 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMA1P25786 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA1P25786 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA1P25786 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMA1P25786 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA1P25786 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA1P25786 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA1P25786 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA1P25786 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA1P25786 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA1P25786 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA1P25786 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMA1P25786 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMA1P25786 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMA1P25786 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMA1P25786 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMA1P25786 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMA1P25786 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMA1P25786 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMA1P25786 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMA1P25786 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMA1P25786 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMA1P25786 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMA1P25786 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMA1P25786 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA1P25786 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMA1P25786 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA1P25786 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA1P25786 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA1P25786 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA1P25786 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA1P25786 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMA1P25786 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA1P25786 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA1P25786 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA1P25786 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA1P25786 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMA1P25786 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA1P25786 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA1P25786 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA1P25786 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA1P25786 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA1P25786 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSMA1P25786 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMA1P25786 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMA1P25786 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMA1P25786 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMA1P25786 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMA1P25786 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMA1P25786 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA1P25786 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA1P25786 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA1P25786 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA1P25786 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA1P25786 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA1P25786 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA1P25786 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMA1P25786 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMA1P25786 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms