Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP12AP54707 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms