Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms