Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MICU2-205ENST00000476895 716 ntTSL 52.48□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 124.8
SF3B1O75533 DOCK2-214ENST00000523351 3777 ntTSL 59.64□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 124.8
SF3B1O75533 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 124.8
SF3B1O75533 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-205ENST00000518408 1552 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-207ENST00000520214 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-216ENST00000523399 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-217ENST00000523924 4756 ntTSL 211.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-215ENST00000523243 4774 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 ZFAT-203ENST00000517307 866 ntTSL 55.19□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 124.7
SF3B1O75533 UBAC2-206ENST00000468067 968 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 124.6
SF3B1O75533 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 411.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 124.6
SF3B1O75533 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 124.6
SF3B1O75533 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 124.4
SF3B1O75533 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 124.4
SF3B1O75533 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 124.4
SF3B1O75533 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 124.4
SF3B1O75533 CDC42BPA-212ENST00000478573 599 ntTSL 53.13□□□□□ -1.914e-7■■■■■ 124.4
SF3B1O75533 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 KRI1-214ENST00000612875 2608 ntTSL 221.84■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 KRI1-203ENST00000478863 2545 ntTSL 219.65■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 ZCWPW2-203ENST00000420223 816 ntTSL 519.6■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 KRI1-204ENST00000536689 3744 ntTSL 212.38□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 124.3
SF3B1O75533 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.582e-12■■■■■ 124.2
SF3B1O75533 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 124.2
SF3B1O75533 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-12■■■■■ 124.2
SF3B1O75533 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-12■■■■■ 124.2
SF3B1O75533 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 124.2
SF3B1O75533 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 325.68■■□□□ 1.74e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 224.83■■□□□ 1.564e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 CCDC84-203ENST00000526463 1295 ntTSL 1 (best)22.65■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 SCRN2-208ENST00000581645 1477 ntTSL 520.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 SCRN2-205ENST00000579856 952 ntTSL 519.17■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 CCDC84-202ENST00000524670 885 ntTSL 519.08■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 CCDC84-206ENST00000532132 1119 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TACC3-205ENST00000467746 966 ntTSL 318.2■□□□□ 0.54e-24■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-21■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 EFCAB11-207ENST00000555608 644 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TACC3-211ENST00000493975 825 ntTSL 315.88■□□□□ 0.134e-24■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 ARV1-207ENST00000497753 1072 ntTSL 515.83■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 C9orf3-211ENST00000463372 919 ntTSL 315.03■□□□□ -04e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TACC3-203ENST00000458173 778 ntTSL 514.96□□□□□ -0.014e-24■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 EFCAB11-212ENST00000556639 2326 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 214.28□□□□□ -0.124e-24■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 BRD9-210ENST00000493082 750 ntTSL 514.15□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 313.98□□□□□ -0.174e-24■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-21■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 ARV1-203ENST00000435927 879 ntTSL 313.38□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 EFCAB11-201ENST00000316738 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.032e-21■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 124.1
SF3B1O75533 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 124
SF3B1O75533 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 124
SF3B1O75533 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 123.9
SF3B1O75533 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.18□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 123.9
SF3B1O75533 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 123.9
SF3B1O75533 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 123.8
SF3B1O75533 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 123.8
SF3B1O75533 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 518.57■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 123.7
SF3B1O75533 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 123.7
SF3B1O75533 TMEM44-207ENST00000430601 682 ntTSL 322.79■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 123.6
SF3B1O75533 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 123.6
SF3B1O75533 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 123.6
SF3B1O75533 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 123.6
SF3B1O75533 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 123.6
SF3B1O75533 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.859e-7■■■■■ 123.5
SF3B1O75533 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 123.5
SF3B1O75533 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 123.5
SF3B1O75533 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 324.26■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 123.5
SF3B1O75533 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 123.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1096.8 ms