RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485989.6

TACC3-210, Transcript of transforming acidic coiled-coil containing protein 3, human

TSL 3

Gene TACC3, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TACC3-210	ENST00000485989	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		31.39	■■■□□ 2.61
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TACC3-210	ENST00000485989	ABCC9	O60706	1549 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TACC3-210	ENST00000485989	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		26.39	■■□□□ 1.82
TACC3-210	ENST00000485989	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		26.36	■■□□□ 1.81
TACC3-210	ENST00000485989	NACAD	O15069	1562 aa		26.29	■■□□□ 1.8
TACC3-210	ENST00000485989	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	26.13	■■□□□ 1.77
TACC3-210	ENST00000485989	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		26.02	■■□□□ 1.76
TACC3-210	ENST00000485989	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		25.88	■■□□□ 1.73
TACC3-210	ENST00000485989	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		25.85	■■□□□ 1.73
TACC3-210	ENST00000485989	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	25.77	■■□□□ 1.72
TACC3-210	ENST00000485989	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		25.64	■■□□□ 1.69
TACC3-210	ENST00000485989	SCRIB	Q14160	1630 aa		25.61	■■□□□ 1.69
TACC3-210	ENST00000485989	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		25.44	■■□□□ 1.66
TACC3-210	ENST00000485989	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		25.23	■■□□□ 1.63
TACC3-210	ENST00000485989	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	24.97	■■□□□ 1.59
TACC3-210	ENST00000485989	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		24.92	■■□□□ 1.58
TACC3-210	ENST00000485989	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		24.77	■■□□□ 1.56
TACC3-210	ENST00000485989	SMARCA4	P51532	1647 aa		24.42	■■□□□ 1.5
TACC3-210	ENST00000485989	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.48
TACC3-210	ENST00000485989	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		24.3	■■□□□ 1.48
TACC3-210	ENST00000485989	NCAPD3	P42695	1498 aa		24.26	■■□□□ 1.47
TACC3-210	ENST00000485989	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		24.24	■■□□□ 1.47
TACC3-210	ENST00000485989	SMARCA2	P51531	1590 aa		24.23	■■□□□ 1.47
TACC3-210	ENST00000485989	HMGXB3	Q12766	1538 aa		24.15	■■□□□ 1.46
TACC3-210	ENST00000485989	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
TACC3-210	ENST00000485989	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		24.11	■■□□□ 1.45
TACC3-210	ENST00000485989	WIZ	O95785	1651 aa		23.99	■■□□□ 1.43
TACC3-210	ENST00000485989	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	23.86	■■□□□ 1.41
TACC3-210	ENST00000485989	NES	P48681	1621 aa		23.84	■■□□□ 1.41
TACC3-210	ENST00000485989	ERCC6	Q03468	1493 aa		23.77	■■□□□ 1.4
TACC3-210	ENST00000485989	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
TACC3-210	ENST00000485989	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		23.67	■■□□□ 1.38
TACC3-210	ENST00000485989	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		23.56	■■□□□ 1.36
TACC3-210	ENST00000485989	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		23.55	■■□□□ 1.36
TACC3-210	ENST00000485989	CUX2	O14529	1486 aa		23.51	■■□□□ 1.35
TACC3-210	ENST00000485989	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		23.5	■■□□□ 1.35
TACC3-210	ENST00000485989	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	23.49	■■□□□ 1.35
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		23.4	■■□□□ 1.34
TACC3-210	ENST00000485989	CFTR	P13569	1480 aa		23.4	■■□□□ 1.34
TACC3-210	ENST00000485989	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		23.34	■■□□□ 1.33
TACC3-210	ENST00000485989	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		23.33	■■□□□ 1.33
TACC3-210	ENST00000485989	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		23.32	■■□□□ 1.32
TACC3-210	ENST00000485989	WDR62	O43379	1518 aa		23.24	■■□□□ 1.31
TACC3-210	ENST00000485989	PRDM2	Q13029	1718 aa		23.23	■■□□□ 1.31
TACC3-210	ENST00000485989	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	23.21	■■□□□ 1.31
TACC3-210	ENST00000485989	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	23.13	■■□□□ 1.29
TACC3-210	ENST00000485989	TOPBP1	Q92547	1522 aa		22.95	■■□□□ 1.26
TACC3-210	ENST00000485989	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		22.95	■■□□□ 1.26
TACC3-210	ENST00000485989	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		22.9	■■□□□ 1.26
TACC3-210	ENST00000485989	ABCC8	Q09428	1581 aa		22.84	■■□□□ 1.25
TACC3-210	ENST00000485989	IFT140	Q96RY7	1462 aa		22.81	■■□□□ 1.24
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	22.79	■■□□□ 1.24
TACC3-210	ENST00000485989	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	22.75	■■□□□ 1.23
TACC3-210	ENST00000485989	CUX1	P39880	1505 aa		22.74	■■□□□ 1.23
TACC3-210	ENST00000485989	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
TACC3-210	ENST00000485989	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	22.69	■■□□□ 1.22
TACC3-210	ENST00000485989	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		22.69	■■□□□ 1.22
TACC3-210	ENST00000485989	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		22.69	■■□□□ 1.22
TACC3-210	ENST00000485989	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	22.63	■■□□□ 1.21	2e-7	■■■□□ 18.5
TACC3-210	ENST00000485989	SOGA1	O94964	1423 aa		22.63	■■□□□ 1.21
TACC3-210	ENST00000485989	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	22.55	■■□□□ 1.2
TACC3-210	ENST00000485989	SYNJ1	O43426	1573 aa		22.51	■■□□□ 1.19
TACC3-210	ENST00000485989	WDR97	A6NE52	1622 aa		22.51	■■□□□ 1.19
TACC3-210	ENST00000485989	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	22.5	■■□□□ 1.19	1e-6	■■■■□ 21.8
TACC3-210	ENST00000485989	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		22.49	■■□□□ 1.19
TACC3-210	ENST00000485989	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		22.48	■■□□□ 1.19
TACC3-210	ENST00000485989	TOP2B	Q02880	1626 aa		22.46	■■□□□ 1.19
TACC3-210	ENST00000485989	CHD1	O14646	1710 aa		22.44	■■□□□ 1.18
TACC3-210	ENST00000485989	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		22.43	■■□□□ 1.18
TACC3-210	ENST00000485989	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		22.41	■■□□□ 1.18
TACC3-210	ENST00000485989	FBLN2	P98095	1184 aa		22.4	■■□□□ 1.18
TACC3-210	ENST00000485989	GRIN2B	Q13224	1484 aa		22.38	■■□□□ 1.17
TACC3-210	ENST00000485989	PBRM1	Q86U86	1689 aa		22.38	■■□□□ 1.17
TACC3-210	ENST00000485989	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		22.37	■■□□□ 1.17
TACC3-210	ENST00000485989	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		22.37	■■□□□ 1.17
TACC3-210	ENST00000485989	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	22.32	■■□□□ 1.16
TACC3-210	ENST00000485989	TRIM41	Q8WV44	630 aa		22.27	■■□□□ 1.16
TACC3-210	ENST00000485989	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	SYNJ2	O15056	1496 aa		22.25	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		22.24	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		22.24	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		22.24	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	ARHGEF11	O15085	1522 aa		22.21	■■□□□ 1.15
TACC3-210	ENST00000485989	ADAMTS12	P58397	1594 aa		22.19	■■□□□ 1.14
TACC3-210	ENST00000485989	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		22.16	■■□□□ 1.14
TACC3-210	ENST00000485989	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		22.13	■■□□□ 1.13
TACC3-210	ENST00000485989	GRIN2A	Q12879	1464 aa		22.11	■■□□□ 1.13
TACC3-210	ENST00000485989	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		22.09	■■□□□ 1.13
TACC3-210	ENST00000485989	CEP170	Q5SW79	1584 aa		22.04	■■□□□ 1.12
TACC3-210	ENST00000485989	ARAP1	Q96P48	1450 aa		22.03	■■□□□ 1.12
TACC3-210	ENST00000485989	KIF27	Q86VH2	1401 aa		22.03	■■□□□ 1.12
TACC3-210	ENST00000485989	NUP160	Q12769	1436 aa		22	■■□□□ 1.11
TACC3-210	ENST00000485989	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		22	■■□□□ 1.11
TACC3-210	ENST00000485989	IGF1R	P08069	1367 aa		21.95	■■□□□ 1.1
TACC3-210	ENST00000485989	CUL7	Q14999	1698 aa		21.91	■■□□□ 1.1
TACC3-210	ENST00000485989	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		21.91	■■□□□ 1.1
TACC3-210	ENST00000485989	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		21.87	■■□□□ 1.09
TACC3-210	ENST00000485989	SHROOM2	Q13796	1616 aa		21.85	■■□□□ 1.09
TACC3-210	ENST00000485989	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		21.84	■■□□□ 1.09

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