Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.36■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.596e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-212ENST00000542091 735 ntTSL 37.41□□□□□ -1.228e-7■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.868e-9■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 34.3
TBRG4Q969Z0 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 219.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 34.1
TBRG4Q969Z0 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 34.1
TBRG4Q969Z0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 224.36■■□□□ 1.491e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 523.27■■□□□ 1.322e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 322.82■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 221.92■■□□□ 1.12e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-205ENST00000425598 661 ntTSL 520.27■□□□□ 0.842e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 AUH-205ENST00000478465 751 ntTSL 320.27■□□□□ 0.842e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-203ENST00000465629 2108 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LPP-204ENST00000420410 535 ntTSL 318.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 318.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-215ENST00000551583 525 ntTSL 217.24■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-204ENST00000579611 580 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-208ENST00000549311 5004 ntTSL 516.2■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-219ENST00000497013 548 ntTSL 215.58■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-209ENST00000479734 441 ntTSL 415.5■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TBC1D8-204ENST00000463469 561 ntTSL 415.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-206ENST00000546772 678 ntTSL 514.9□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 GREB1-209ENST00000472040 571 ntTSL 514.6□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TSC1-206ENST00000490179 681 ntTSL 314.59□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-205ENST00000472680 440 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 414.15□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LPP-207ENST00000443217 400 ntTSL 313.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 CDC42EP4-207ENST00000581045 539 ntTSL 412.88□□□□□ -0.351e-11■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-206ENST00000477307 1293 ntTSL 410.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 210.44□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 510.24□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 59.69□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 59.69□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 RNF103-202ENST00000463333 686 ntTSL 59.54□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 39.28□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 AUH-204ENST00000475023 641 ntTSL 29.03□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 34
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -18e-7■■■■■ 34
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