Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms