Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNI3KQ59H18 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNI3KQ59H18 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms