Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 ITCH-206ENST00000486883 703 ntTSL 25.48□□□□□ -1.531e-9■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 317.87■□□□□ 0.453e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-209ENST00000533515 774 ntTSL 513.31□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 313.08□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 SLC43A1-203ENST00000525764 556 ntTSL 312.97□□□□□ -0.333e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.184e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-7■■□□□ 12.3
ILF3Q12906 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-18■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-18■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 33.87□□□□□ -1.792e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 WNK4-203ENST00000587745 188 ntTSL 53.61□□□□□ -1.832e-18■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.861e-9■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 CERS4-210ENST00000559490 420 ntTSL 521.32■■□□□ 16e-7■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 314.86□□□□□ -0.031e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 513.37□□□□□ -0.271e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.351e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-229ENST00000513027 697 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-223ENST00000510199 1100 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 310.02□□□□□ -0.811e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 59.77□□□□□ -0.851e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 59.64□□□□□ -0.871e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-234ENST00000515417 873 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)9.26□□□□□ -0.931e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 59.11□□□□□ -0.951e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-208ENST00000503494 843 ntTSL 39.02□□□□□ -0.971e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.977e-7■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.011e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 58.52□□□□□ -1.051e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.081e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 28.28□□□□□ -1.081e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-213ENST00000506312 559 ntTSL 57.92□□□□□ -1.141e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 37.91□□□□□ -1.141e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 57.65□□□□□ -1.183e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.247e-7■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 26.43□□□□□ -1.381e-11■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 35□□□□□ -1.611e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-9■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-6■■□□□ 12.2
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ILF3Q12906 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 510.58□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.412e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 29.88□□□□□ -0.832e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-13■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 AGFG2-202ENST00000429987 928 ntTSL 317.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 34.09□□□□□ -1.753e-39■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 322.3■■□□□ 1.167e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 420.68■□□□□ 0.97e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 418.39■□□□□ 0.537e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 218.39■□□□□ 0.537e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.517e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 418.24■□□□□ 0.517e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.287e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 410.59□□□□□ -0.717e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-214ENST00000519635 578 ntTSL 48.88□□□□□ -0.997e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 38.23□□□□□ -1.097e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 48.09□□□□□ -1.117e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 48.02□□□□□ -1.137e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 47.63□□□□□ -1.197e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 47.53□□□□□ -1.27e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 47.52□□□□□ -1.217e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 37.3□□□□□ -1.247e-8■■□□□ 12.2
ILF3Q12906 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.687e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.067e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.47e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.017e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 07e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.297e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 PPM1H-204ENST00000551214 862 ntTSL 39.05□□□□□ -0.967e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SETD2-208ENST00000492397 746 ntTSL 38.55□□□□□ -1.047e-9■■□□□ 12.1
ILF3Q12906 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.883e-20■■□□□ 12.1
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