Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-216ENST00000556000 2092 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 215.51■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.375e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 160.4
UTP3Q9NQZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.368e-7■■■■■ 160.3
UTP3Q9NQZ2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 160.3
UTP3Q9NQZ2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 160.3
UTP3Q9NQZ2 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 160.3
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 222.7■■□□□ 1.222e-9■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-205ENST00000485896 1429 ntTSL 222.31■■□□□ 1.162e-9■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-207ENST00000475680 1138 ntTSL 522.08■■□□□ 1.138e-10■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-204ENST00000442670 622 ntTSL 217.12■□□□□ 0.338e-10■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 310.36□□□□□ -0.758e-10■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.758e-10■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-206ENST00000467766 585 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.818e-10■■■■■ 160.2
UTP3Q9NQZ2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 160.1
UTP3Q9NQZ2 EP400-208ENST00000611841 3129 ntTSL 512.49□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 160
UTP3Q9NQZ2 SSBP3-211ENST00000528787 577 ntTSL 48.38□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 160
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 160
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 160
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 160
UTP3Q9NQZ2 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SPTLC1-206ENST00000482632 837 ntTSL 510.76□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.359e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.819e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-206ENST00000502756 796 ntTSL 225.63■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.59e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 USP53-203ENST00000507597 503 ntTSL 321.45■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC12A2-206ENST00000509205 4263 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 520.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.659e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 POFUT2-205ENST00000460932 616 ntTSL 217.63■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.399e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 USP53-206ENST00000510737 534 ntTSL 513.74□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-226ENST00000514931 550 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-205ENST00000586175 874 ntTSL 212.1□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-210ENST00000568820 1695 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-207ENST00000567165 931 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-207ENST00000505185 225 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 47.19□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 47.04□□□□□ -1.281e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 46.27□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 RAI14-210ENST00000507502 340 ntTSL 35.72□□□□□ -1.491e-9■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 CLUH-210ENST00000574426 3844 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 159.9
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.74e-8■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.364e-8■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 514.1□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-205ENST00000415798 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.45□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 29.68□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 39.11□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 28.6□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 28.39□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 159.8
UTP3Q9NQZ2 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 29.1□□□□□ -0.951e-10■■■■■ 159.7
UTP3Q9NQZ2 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 27.67□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 159.7
UTP3Q9NQZ2 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 159.7
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 159.7
UTP3Q9NQZ2 DDB1-213ENST00000539332 1767 ntTSL 29.42□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 GUSBP11-201ENST00000422506 2055 ntTSL 223.56■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 GUSBP11-205ENST00000452737 1662 ntTSL 1 (best)23.35■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 159.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1256.7 ms