Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.967e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-214ENST00000513735 600 ntTSL 56.4□□□□□ -1.387e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.397e-12■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.42e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 PAPD4-208ENST00000504982 600 ntTSL 23.66□□□□□ -1.827e-12■■■□□ 14.9
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TARDBPQ13148 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.53□□□□□ -0.564e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 511.49□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 411.49□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 411.49□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-219ENST00000530840 531 ntTSL 511.49□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 411.49□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.4□□□□□ -0.584e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.33□□□□□ -0.64e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 410.67□□□□□ -0.74e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.63□□□□□ -0.874e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 29.49□□□□□ -0.894e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.124e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.81□□□□□ -1.644e-6■■■□□ 14.9
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TARDBPQ13148 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-6■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 USP6NL-203ENST00000443016 2491 ntTSL 28.82□□□□□ -16e-10■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.082e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■□□ 14.9
TARDBPQ13148 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 14.9
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TARDBPQ13148 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.571e-11■■■□□ 14.9
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TARDBPQ13148 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.358e-6■■■□□ 14.8
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TARDBPQ13148 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.053e-8■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 PABPC1-202ENST00000517403 560 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-57■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-209ENST00000568865 1332 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 514.32□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-208ENST00000566695 828 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 310.78□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 PRR4-209ENST00000541456 454 ntTSL 35.5□□□□□ -1.539e-7■■■□□ 14.8
TARDBPQ13148 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 SYNJ2-205ENST00000449320 680 ntTSL 47.62□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 519.79■□□□□ 0.761e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.511e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 315.94■□□□□ 0.141e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 210.27□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 14.7
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