RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583528.5

SPECC1-222, Transcript of sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, human

TSL 5

Gene SPECC1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPECC1-222	ENST00000583528	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.5	■■■■□ 3.75
SPECC1-222	ENST00000583528	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.46	■■■■□ 3.11
SPECC1-222	ENST00000583528	ABCC9	O60706	1549 aa		34.45	■■■■□ 3.11
SPECC1-222	ENST00000583528	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SPECC1-222	ENST00000583528	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SPECC1-222	ENST00000583528	NACAD	O15069	1562 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SPECC1-222	ENST00000583528	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SPECC1-222	ENST00000583528	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.14	■■■□□ 2.74
SPECC1-222	ENST00000583528	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SPECC1-222	ENST00000583528	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPECC1-222	ENST00000583528	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SPECC1-222	ENST00000583528	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SPECC1-222	ENST00000583528	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPECC1-222	ENST00000583528	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SPECC1-222	ENST00000583528	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SPECC1-222	ENST00000583528	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SPECC1-222	ENST00000583528	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
SPECC1-222	ENST00000583528	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.01	■■■□□ 2.55
SPECC1-222	ENST00000583528	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SPECC1-222	ENST00000583528	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.02	■■■□□ 2.4
SPECC1-222	ENST00000583528	SMARCA4	P51532	1647 aa		30	■■■□□ 2.39
SPECC1-222	ENST00000583528	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SPECC1-222	ENST00000583528	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
SPECC1-222	ENST00000583528	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SPECC1-222	ENST00000583528	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SPECC1-222	ENST00000583528	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
SPECC1-222	ENST00000583528	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SPECC1-222	ENST00000583528	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SPECC1-222	ENST00000583528	NES	P48681	1621 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SPECC1-222	ENST00000583528	CUX2	O14529	1486 aa		29.59	■■■□□ 2.33
SPECC1-222	ENST00000583528	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.47	■■■□□ 2.31
SPECC1-222	ENST00000583528	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.39	■■■□□ 2.29
SPECC1-222	ENST00000583528	WIZ	O95785	1651 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SPECC1-222	ENST00000583528	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SPECC1-222	ENST00000583528	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SPECC1-222	ENST00000583528	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SPECC1-222	ENST00000583528	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SPECC1-222	ENST00000583528	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SPECC1-222	ENST00000583528	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SPECC1-222	ENST00000583528	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SPECC1-222	ENST00000583528	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SPECC1-222	ENST00000583528	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SPECC1-222	ENST00000583528	CFTR	P13569	1480 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SPECC1-222	ENST00000583528	WDR62	O43379	1518 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SPECC1-222	ENST00000583528	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SPECC1-222	ENST00000583528	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SPECC1-222	ENST00000583528	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SPECC1-222	ENST00000583528	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SPECC1-222	ENST00000583528	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SPECC1-222	ENST00000583528	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SPECC1-222	ENST00000583528	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SPECC1-222	ENST00000583528	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SPECC1-222	ENST00000583528	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
SPECC1-222	ENST00000583528	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SPECC1-222	ENST00000583528	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SPECC1-222	ENST00000583528	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SPECC1-222	ENST00000583528	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08
SPECC1-222	ENST00000583528	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SPECC1-222	ENST00000583528	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SPECC1-222	ENST00000583528	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SPECC1-222	ENST00000583528	SOGA1	O94964	1423 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SPECC1-222	ENST00000583528	FBLN2	P98095	1184 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SPECC1-222	ENST00000583528	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SPECC1-222	ENST00000583528	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SPECC1-222	ENST00000583528	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SPECC1-222	ENST00000583528	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SPECC1-222	ENST00000583528	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SPECC1-222	ENST00000583528	CUX1	P39880	1505 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SPECC1-222	ENST00000583528	CHD1	O14646	1710 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SPECC1-222	ENST00000583528	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SPECC1-222	ENST00000583528	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SPECC1-222	ENST00000583528	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SPECC1-222	ENST00000583528	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SPECC1-222	ENST00000583528	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SPECC1-222	ENST00000583528	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SPECC1-222	ENST00000583528	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SPECC1-222	ENST00000583528	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SPECC1-222	ENST00000583528	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.57	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.57	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.56	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.55	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.55	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2
SPECC1-222	ENST00000583528	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SPECC1-222	ENST00000583528	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SPECC1-222	ENST00000583528	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.45	■■□□□ 1.98
SPECC1-222	ENST00000583528	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.44	■■□□□ 1.98
SPECC1-222	ENST00000583528	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
SPECC1-222	ENST00000583528	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.32	■■□□□ 1.96
SPECC1-222	ENST00000583528	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.3	■■□□□ 1.96
SPECC1-222	ENST00000583528	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.27	■■□□□ 1.96
SPECC1-222	ENST00000583528	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.23	■■□□□ 1.95
SPECC1-222	ENST00000583528	NUP160	Q12769	1436 aa		27.2	■■□□□ 1.94
SPECC1-222	ENST00000583528	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.19	■■□□□ 1.94
SPECC1-222	ENST00000583528	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.11	■■□□□ 1.93
SPECC1-222	ENST00000583528	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.02	■■□□□ 1.92
SPECC1-222	ENST00000583528	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.01	■■□□□ 1.91
SPECC1-222	ENST00000583528	KIF27	Q86VH2	1401 aa		26.99	■■□□□ 1.91
SPECC1-222	ENST00000583528	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	26.99	■■□□□ 1.91
SPECC1-222	ENST00000583528	IGF1R	P08069	1367 aa		26.94	■■□□□ 1.9

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