Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A3GALT2U3KPV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A3GALT2U3KPV4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A3GALT2U3KPV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms