Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC48.44■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
DCAF1Q9Y4B6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
DCAF1Q9Y4B6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC48.36■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC48.33■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
DCAF1Q9Y4B6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.26■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC48.19■■■■■ 5.31
DCAF1Q9Y4B6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC48.17■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.16■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC48.16■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC48.14■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms